آمونیاک یک ماده سمی برای آبزیان است. مقدار آمونیاک به مقدار اکسیژن محلول، pH و قلیائیات آب وابسته است.غلظت آمونیاک غیر یونی (NH3) در آب حوضچهها باید همواره کمتر از ۰٫۵ میلیگرم در هر لیتر باشد.